Waoundé a été fondé il y a de cela plusieurs siècles. Il est à la limite de la Province Soninké appelée Haïré.

Autrefois appelé  "Dirango", Waoundé doit son nom à El Hadji Oumar TALL, qui, après avoir été chaleureusement accueilli lors de son passage à Waoundé par les femmes, bénit le village et prononça les termes suivants en pulaar « yo wawou houndé » avant de prendre congé de ses hôtes. Cette expression s’est transformée par la suite en « Waoundé » et a remplacé petit à petit le nom original du village qui était « Dirango ».

Fondée vers 1227 par les Soninké, Waoundé est actuellement à son troisième emplacement physique. Waoundé se situait d’abord sur la  rive droite du fleuve (cette rive fait actuellement partie de la Mauritanie) puis  sur la rive gauche mais sur la côte sablonneuse (Kotié) du fleuve avant de s’établir définitivement sur son emplacement actuel sur la rive gauche.

Waoundé est composé majoritairement de familles d’ethnie Soninké. Il existe aussi d’autres familles d’ethnie Bambara appelées « Somono » ainsi que des familles d’ethnie Peul appelées « Thioubalo ». Les Somono et les Thioubalo sont originellement des familles de pêcheurs qui vivent en harmonie avec les Soninké. L’activité principale des Soninké a toujours été la culture des champs.

Les principales familles composant Waoundé sont :

- Les Soumaré : Waoundé a été fondé par les Soumaré, et de ce fait, la chefferie traditionnelle (pouvoir temporel) revient aux Soumaré.

- Les Cissé : Il existe 3 grandes familles maraboutiques Cissé : 

- Les Diagana : également famille maraboutique, n’ont pas de rôle dans la direction de la prière à la Grande Mosquée, mais s’occupent de l’instruction islamique de beaucoup d’étudiants venus des fins fond des provinces Soninké, et même de Gambie.

- Les Gassama et Diakhaté : autres familles maraboutiques

- Les Camara : ou Ganeganko, ils sont originaires de la province Soninké du Guidimakha

- Les Siby : appelés Mangu

- Les Traoré, Coulibaly, Cissokho, etc : neutres ou Dionkourou

- Les Ndiaye : Originaires du Village de Moudery

- Les Kanté, Kossoré, Yatéra, etc :  familles griotiques

- etc.. la liste n’est pas exhaustive et ne demande qu’à être complétée. Pour plus de détails sur tous les noms de familles qu’on peut trouver à Waoundé, voir la Liste des Noms de Famille.

Le premier chef de village de Waoundé s’appelle Samidiaka.

Liste de quelques personnes ayant régné en tant que chef de village entre le 19ème et la fin du 20ème siècle (cette liste n'est pas dans l'ordre chronologique) :

Diadié Fatouma Soumaré
Fassa Diadié Soumaré
Sarko Diadié Soumaré
Bolo Diadié Soumaré
Douga Diadié Soumaré
Samba Morry Soumaré
Dionga Faourou Soumaré
Bakary Fatouma Soumaré
Samba Niamé  Soumaré
Faourou Gaye Soumaré
Samba Feinda Soumaré
Diadié Dionga Soumaré
Mamadou Fassa Soumaré
Mamadou Dionga Soumaré
Bassirou Sarko Soumaré
Dramane Sarko  Soumaré
Yaya Gaye Soumaré
Bassirou Bounda  Soumaré

Liste des derniers chefs du pouvoir spirituel. Le pouvoir spirituel est exercé par l'aîné des familles maraboutiques (cette liste n'est pas dans l'ordre chronologique):

Salou Cissé
Idrissa Diégué Cissé
Diadié Siakha Cissé
Ibrahima Mounina Cissé
Boulaye Absata Cissé
Bounda Absata Cissé
Bouna Diarra Cissé
Mamadou Waoundé Cissé
Fodié Mamadou Cissé
Mory Sayély Cissé
Bakary Bouly Cissé
Ladji Khoumba Cissé
Founoulémé Daouda Cissé ( actuel chef )

Liste des derniers Imams de la Grande Mosquée. Le chef du pouvoir spirituel est la personne qui doit assurer le rôle de l'Imam à la Grande Mosquée de Waoundé, mais, il arrive qu'un chef délégue cette responsabilité à une autre personne (cette liste n'est pas dans l'ordre chronologique):

Kandiam Khassé Cissé
Idrissa Diégué Cissé
Siaïbou Diaguily Cissé
Boulaye Absata Cissé
Mamadou Doumbé Cissé
Moody Xooré Cissé
Doumbé Dieynaba Cissé